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SnapGene官方版(分子生物學(xué)工具)

版本:v7.1.05 大?。?19.79M 語言:簡體中文 類別:健康醫(yī)藥
  • 類型:國產(chǎn)軟件
  • 授權(quán):免費(fèi)軟件
  • 更新:2023-12-11
  • 環(huán)境:Windows11,Windows10,Windows8,Windows7
  • 本地下載
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情介紹

SnapGene官方版是一款功能強(qiáng)大且專業(yè)權(quán)威的分子生物學(xué)的軟件,它模擬了Clontech的In-Fusion克隆技術(shù),只需選擇您想要融合的DNA片段,即可設(shè)計(jì)引物,是創(chuàng)建無縫基因融合的一種非常通用的方法。軟件能夠非常直觀的注釋分析和DNA圖譜,用于創(chuàng)建和共享豐富的注釋文件,幫助我們準(zhǔn)確清晰地為分子生物學(xué)繪制相關(guān)圖形。除此之外,SnapGene界面友好,使用簡單,記錄全面,融合了DNAstar和DNAman等軟件的特點(diǎn),用戶可以直接將實(shí)驗(yàn)的每個(gè)DNA構(gòu)建體以電子格式記錄下來,輕松的幫助您完成所需要的工作。需要的朋友歡迎前來下載體驗(yàn)。

SnapGene官方版特色

1、In-Fusion 克隆
Clontech的In-Fusion克隆技術(shù)是創(chuàng)建無縫基因融合的一種非常通用的方法。SnapGene是第一個(gè)模擬此程序的軟件。只需選擇您想要融合的DNA片段,SnapGene即可設(shè)計(jì)引物。
2、GibsonAssembly
許多研究人員轉(zhuǎn)向吉布森大會,不使用限制性內(nèi)切酶將片段插入質(zhì)粒。通過PCR擴(kuò)增待連接的DNA片段以產(chǎn)生重疊末端。SnapGene簡化了吉布森裝配反應(yīng)的計(jì)劃,并自動(dòng)化了底漆設(shè)計(jì)。
3、限制性克隆
SnapGene獨(dú)特的限制克隆界面以干凈的布局顯示您需要的信息。規(guī)劃克隆程序從未如此簡單。如果你已經(jīng)知道你想要做什么,克隆模擬只需要幾秒鐘。如果克隆程序存在設(shè)計(jì)缺陷,則可以在模擬過程中捕獲并糾正錯(cuò)誤。
4、PCR&誘變 
設(shè)計(jì)引物后,可用它們來模擬常規(guī)PCR,重疊延伸PCR或誘變。產(chǎn)生的DNA序列文件立即可用于進(jìn)一步操作。與限制性克隆界面一樣,針對引物的界面以直觀的方式顯示關(guān)鍵信息。
5、自動(dòng)文檔 
SnapGene最令人驚奇的地方在于它會自動(dòng)記錄克隆項(xiàng)目中的步驟。每次編輯序列或模擬克隆或PCR或誘變時(shí),該程序都會自動(dòng)記錄在圖形歷史記錄中。在模擬DNA構(gòu)建體的創(chuàng)建之后,您可以將歷史記錄用作實(shí)驗(yàn)方案。嵌入在最終文件中的是所有的祖先構(gòu)造,其中的每一個(gè)都可以作為單獨(dú)的文件復(fù)活。

安裝教程

1、在本站下載并解壓,雙擊SnapGene.exe運(yùn)行,選擇安裝路徑,點(diǎn)擊next

2、許可協(xié)議,點(diǎn)擊i agree

3、現(xiàn)在安裝附件,用戶可以根據(jù)需求安裝;

4、安裝完成,點(diǎn)擊finish即可。

使用教程

限制性克隆的技巧
對于許多應(yīng)用,常規(guī)限制性克隆仍然是最好的方法。一些簡單的技巧將有助于確保您的克隆順利進(jìn)行。
1、一般技巧
首先,在程序的每一步都要小心。從長遠(yuǎn)來看,這種方法可以節(jié)省時(shí)間。
確保DNA非常干凈。當(dāng)制備載體或切除待插入的片段時(shí),從約2μg的DNA開始。
每次酶促反應(yīng)后,用旋轉(zhuǎn)柱純化DNA。在40-45μl的10mM Tris(pH8.5)中洗脫DNA,然后進(jìn)行下一步反應(yīng)。(在用凝膠純化DNA片段之前不需要使用旋轉(zhuǎn)柱。)
為了最大限度地提高效率,請盡量減少程序中的步驟數(shù)。例如,將鈍端片段克隆到鈍性載體位點(diǎn)(例如SmaI位點(diǎn))比將其用Klenow或T4 DNA聚合酶鈍化的位點(diǎn)更好。
如有疑問,用凝膠純化DNA片段。更清潔的起始材料將產(chǎn)生更好的結(jié)果。
2、準(zhǔn)備矢量
限制性克隆最常見的問題是在手術(shù)后恢復(fù)起始載體。該問題有兩個(gè)原因:載體的不完全消化,以及切割載體與其自身的重新連接。下面描述的技巧將最大限度地減少這些影響。
確保載體的消化完成。使用過量的限制酶(約20 U,2μgDNA),消化約4小時(shí)。如果載體需要用兩種具有不同最佳反應(yīng)緩沖液的酶切割,則依次進(jìn)行消化,并在其間進(jìn)行旋轉(zhuǎn)柱純化。
消化載體(并且如果合適的話鈍化),用磷酸酶處理:在37℃下1小時(shí)處于5'突出端,或者如果DNA具有任何平末端或3'突出端則在50℃處理1小時(shí)。
用旋轉(zhuǎn)柱除去磷酸酶。通常不需要對載體進(jìn)行凝膠純化,因?yàn)榱姿崦柑幚頃巩a(chǎn)生的任何額外DNA片段失活。
3、使用載體,確保消化和磷酸酶反應(yīng)完成。徹底和反復(fù)地渦旋混合物,并且不允許任何液滴逃脫酶處理。在渦旋后短暫旋轉(zhuǎn)以確保管側(cè)沒有留下液滴是個(gè)好主意。
準(zhǔn)備插入的片段
為了制備插入的片段,不完全消化不是一個(gè)嚴(yán)重的問題,因?yàn)槠蔚牟糠只厥帐强山邮艿摹D梢允褂孟鄬^短的消化時(shí)間,對于雙重消化,您可以使用對一種或兩種酶來說不是最理想的反應(yīng)緩沖液。
用凝膠純化插入的片段。除去除不需要的或不完全消化的DNA外,該方法還可去除酶和小分子。當(dāng)用透照儀觀察DNA條帶時(shí),不要使用312nm或更低的短波紫外線,因?yàn)镈NA會受到嚴(yán)重?fù)p害。請改用360-365 nm紫外燈。
如果通過PCR產(chǎn)生插入的片段,則在進(jìn)行任何限制性消化之前用凝膠或旋轉(zhuǎn)柱純化。如果您計(jì)劃將平末端PCR片段(用聚合酶如Pfu產(chǎn)生)克隆到磷酸酶處理的載體中,請確保您的PCR引物含有5'-磷酸。
結(jié)扎和轉(zhuǎn)化
使用磷酸酶處理的載體,進(jìn)行對照連接,其中省略插入的片段。該對照連接應(yīng)該產(chǎn)生非常少的轉(zhuǎn)化體,因?yàn)橹挥协h(huán)狀DNA分子有效地轉(zhuǎn)化大腸桿菌,并且在不與磷酸化片段連接的情況下不能發(fā)生載體的再環(huán)化。
如果DNA僅有粘性末端,則在室溫下連接約1小時(shí)。如果DNA具有任何平端,則在室溫下連接約4小時(shí)并使用高濃度T4連接酶。
微量制作和診斷摘要
如果您使用插入的片段獲得了比用于對照連接的結(jié)扎更多的轉(zhuǎn)化體,那么您的克隆幾乎肯定會起作用,并且您通常只能制作3-4個(gè)小量制備物。
在執(zhí)行小量制備的診斷限制摘要時(shí),始終包括起始向量作為參考標(biāo)準(zhǔn)。

軟件優(yōu)點(diǎn)

為學(xué)生,博士后和技術(shù)人員帶來的好處
工作更快,更聰明
SnapGene 使您的 DNA 操作易于可視化和模擬,并在錯(cuò)誤發(fā)生之前提醒您。
保持記錄不費(fèi)吹灰之力
SnapGene 中的每個(gè) DNA 操作都會自動(dòng)記錄,因此您可以準(zhǔn)確地看到您所做的操作并檢索祖先結(jié)構(gòu)的序列。
隨時(shí)隨地學(xué)習(xí)
如果您不熟悉克隆或特定技術(shù),豐富直觀的 SnapGene 界面可幫助您了解其工作原理。
輕松與世界各地的同事共享數(shù)據(jù)
SnapGene 的 .dna 文件可以通過免費(fèi)的跨平臺 SnapGene Viewer 打開,使您能夠與同事共享豐富的帶注釋的地圖和序列。
PI 和實(shí)驗(yàn)室管理器的好處
更快地獲得結(jié)果
實(shí)驗(yàn)室中的人員將不再使用有缺陷的克隆程序浪費(fèi)時(shí)間,并將在第一時(shí)間開始獲得正確的構(gòu)造。
花更少的時(shí)間教人們?nèi)绾慰寺?br /> SnapGene 是一個(gè)很好的教學(xué)工具,甚至新手克隆人也會很快學(xué)會如何自己解決問題。

載地址

  • 電腦版
SnapGene官方版(分子生物學(xué)工具) v7.1.05

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